Chapter 3 SHUD模型软件与数据
3.1 安装 SHUD and rSHUD
本章介绍SHUD模型和rSHUD的安装过程,以及必要的开发库的安装。
3.1.1 SUNDIALS/CVODE
SHUD模型的求解需要SUNDIAL中CVODE库的支持。 SUNDIALS(SUite of Nonlinear and Differential/ALgebraic equation Solvers)由六个求解器组成;其中的 CVODE 是一个用于求解刚性和非刚性常微分方程系统(初始值问题)的数值求解器,数学表达为: \(y' = f(t,y)\). CVODE支持可变阶精度、可变步长数值方法。CVODE字母组合含义为“C版本的可变系数常微分方程求解器(Variable-Coefficient Ordinary Differential Equation Solver)” 。使用SHUD模型只需要CVODE支持,因此无需安装SUNDIALS所有求解器,只需要安装CVODE即可。
因为SUNDIALS/CVODE持续更新中,代码和函数定义等等变化较大,因此SHUD模型通常仅支持CVODE较新版本,并非所有版本都可支持。
SUNDIALS/CVODE的安装方法有两种:(1)自行下载安装包; (2)使用SHUD源代码的安装脚本。
3.1.1.1 使用脚本安装CVODE
源代码文件夹中的configure.sh
文件是自动安装CVODE的脚本——可以自动从github上下载CVODE最新源代码并通过cmake
编译并安装在用户目录
下。
3.1.1.2 自行下载并安装CVODE
SUNDIALS/CVODE 代码的下载地址为:https://computation.llnl.gov/projects/sundials/sundials-software。
CVODE 5.x安装步骤:
- 进入命令行界面,并解压下载好的cvode压缩包。
- 在CVODE的根目录下新建文件夹 builddir, 并进入该文件夹。
mkdir builddir
cd builddir/
- 测试 ccmake. 如果没有
cmake
请安装。
ccmake
- 运行ccmake配置安装环境。
ccmake ../sundials/cvode-5.0.0
首先出现的是空白配置页面。按c开始配置。
上图为默认的配置信息图片上的四处配置信息需要注意,值需要改为下面的值。OPENMP值需要您的系统支持OpenMP,因此在确认您的系统支持OpenMP的情况下打开。
BUILD_CVODE = ON
CMAKE_INSTALL_PREFIX = ~/sundials
EXAMPLES_INSTALL_PATH = ~/sundials/examples
以上值修改完成后,按c确认配置。
ccmake开始自动配置安装参数。当配置完成后,按g生成配置文件并退出。
- 然后使用make编译并安装:
make
make install
3.1.2 编译SHUD
编译信息保存在文件Makefile,其中关键的编译参数:
- SUNDIALS_DIR的保存路径(非常关键). 默认值为 ~/sundials,如果您已经安装到此路径,即可保持默认值。
- OpenMP的路径。当您的系统支持OpenMP时,可根据实际安装路径配置。
- SRC_DIR路径。默认值为
SRC_DIR = .
,即当前源码所在路径。 - BUILT_DIR路径,默认值为
BUILT_DIR = .
,即当前源码所在路径。
配置好Makefile文件即可编译,使用以下命令进行编译:
make clean
make shud
更多可选的编译参数:
make all
- 清理旧的编译文件,并编译SHUD和SHUD_omp文件。make help
- 展示编译的帮助信息。make shud
- 编译shud模型的可执行文件。make shud_omp
- 编译OpenMP支持的并行版本,编译后的可执行文件名为shud_omp。
3.1.2.1 OpenMP(可选)
当需要并行计算时,需要安装OpenMP。以下为Mac OS上安装的参数:
brew install llvm clang
brew install libomp
compile flags for OpenMP:
-Xpreprocessor -fopenmp -lomp
Library/Include paths:
-L/usr/local/opt/libomp/lib
-I/usr/local/opt/libomp/include
3.1.2.2 运行 SHUD 可执行文件
运行SHUD模型,请在命令行内执行一下命令:
./shud <projectname>
命令的参数模式:
./shud [-0][-p projectfile] [-o output] [-n Num_Threads] <project_name>
-0
空计算。读取输入文件并写出结果文件,但是内部没有计算。仅仅用于验证输入文件格式的可靠性和可用性。<project name>
项目名称。所有的项目文件必须以此开头。[-p projectfile]
指定的项目配置文件,文件中包含了所有输入文件的地址。[-o output_folder]
制定的结果文件输出地址。默认的输出地址为output/projname.out
。[-n Num_Threads]
并行计算的线程数量。此参数仅在并行计算打开时可用。
当shud
程序正常运行时,屏幕输出应该如下图所示:
3.1.3 rSHUD
rSHUD是一个标准R包,但尚未向CRAN提交,因此需要通过github以源码方式安装。在R环境中执行以下命令即可自动安装rSHUD。
如果您的电脑上尚未在R环境中安装devtools
,请先安装。
install.packages('devtools')
然后通过devtools
从github上安装rSHUD。
devtools::install_github('SHUD-System/rSHUD')
rSHUD依赖的R工具包包括:
- Rcpp
- reshape2
- ggplot2
- gridExtra
- grid
- fields
- xts
- hydroGOF
- zoo
- raster (>= 2.1.0)
- sp
- rgeos
- RTriangle
- rgdal (>= 1.1.0)
- proj4
- abind
- utils
- lubridate
- geometry
- methods
- ncdf4
- GGally
- doParallel
3.2 模型输入数据
本节从原始数据要求到输入文件内涵,向用户详细介绍模型输入数据。
3.2.1 原始数据
类型 | 数据名 | 必要性 | 要求(格式、步长、数量) | 说明 |
---|---|---|---|---|
空间数据 | 流域边界 | 高 | 矢量 | 连续、封闭、唯一多边形; |
空间数据 | 河流网络 | 高 | 矢量 | 河流具有方向性;河流无向下分叉; |
空间数据 | 高程 | 高 | 0 | 单位:米 |
空间数据 | 土地利用分类 | 中 | 矢量/栅格 | \(n_{lc}\)个分类 |
空间数据 | 土壤分类 | 中 | 矢量/栅格 | \(n_s\)个分类 |
空间数据 | 气象站点 | 中 | 矢量/栅格 | \(n_{fc}\)个站点 |
参数 | 土地利用 | 中 | \(n_{lc}\) 组 | 土地利用的水力学参数 |
参数 | 土壤 | 中 | \(n_s\)组 | 土壤性质:Silt百分比、Clay百分比、有机质含量、Bulk Density |
时间序列数据 | 气象驱动 | 高 | 小时~日 | 降雨、气温、湿度、辐射、风速、气压 |
时间序列数据 | 叶面积指数(LAI) | 中 | 小时~月 | 每类土地利用一个LAI时间序列 |
时间序列数据 | 融化系数 | 低 | 小时~月 | 一个时间序列 |
时间序列数据 | 观测数据 | 高 | 小时~月 | 通常为径流数据、地下水、蒸散发等 |
3.2.1.1 数据实例
南苏丹Pongo流域原始数据实例:流域边界(绿色实线),河流(红色实线)、DEM(背景)和气象站点覆盖范围(黑色虚线)。气象数据站点为GLDAS数据,因此为$ 0.25 x 0.25 $度覆盖范围。 |
(a) Percentage of silt | (b) Percentage of Clay |
(c) Organic mater (Organic Carbon) | (d) Bulk density |
南苏丹Pongo流域土壤数据:Silt百分比,Clay百分比,有机物含量,Bulk Density。数据来源:ISRIC_SoilGrids。 |
南苏丹Pongo流域土地利用信息。土地利用数据来自USGS GLC数据。 |
FLDAS数据的覆盖范围,即气象站点位置信息。 |
FLDAS的气象驱动数据。 |
3.2.2 模型输入文件
输入文件列表
File | Category | 备注 | Header | # of column |
---|---|---|---|---|
.mesh | sp | 三角形单元定义 | 是 | |
.att | sp | 单元属性表 | 是 | |
.riv | sp | 河流 | 是 | |
.rivseg | sp | 三角形单元与河道单元拓扑信息 | 是 | |
.calib | cfg | 物理参数校准文件 | 是 | |
.para | cfg | 模型运行设置参数文件 | 是 | |
.ic | cfg | 模型初始条件 | 是 | |
.geol | para | 地下水层的水力学参数 | 是 | |
.soil | para | 浅层土壤的水力学参数 | 是 | |
.lc | para | 土地利用的水力学和能量参数 | 是 | |
.forc | tsd | 气象驱动数据文件的列表 | 是 | |
.csv | tsd | 气象驱动时间序列数据 | 是 | |
.lai | tsd | 叶面积指数 | 是 | |
.obs | tsd | 用于校准观测时间序列数据 | 是 | |
.mf | tsd | 融雪参数时间序列数据 | 是 | |
.rl | tsd | 计算潜在蒸散发的粗糙度时间序列数据 | 是 | |
gis/domain | 三角形单元的矢量文件 | x | x | |
gis/river | Shapefile | 河段的矢量文件 | x | x |
gis/seg | Shapefile | 被三角形分割的河段矢量文件 | x | x |
在文件夹 gis 和 fig 中的文件与SHUD模拟无关,然后在数据分析和可视化中有很大作用,因此保留在输入文件当中。
3.2.3 空间数据
3.2.3.1 .sp.mesh 文件
.mesh 文件中有两个表格,第一个表格为三角形的组成和拓扑关系;第二个表格为组成三角形的节点坐标信息。
表格 1 (三角形单元的几何定义)
表头
值1 | 值2 |
---|---|
行数 ( \(N_{cell}\)) | 列数 (\(8\)) |
- 表
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
ID | 单元序号 \(i\) | 1 ~ \(N_{cell}\) | - | |
Node1 | 三角形单元第1角点\(i\) | 1 ~ \(N_{node}\) | - | |
Node2 | 三角形单元第2角点 \(i\) | 1 ~ \(N_{node}\) | - | |
Node3 | 三角形单元第3角点 \(i\) | 1 ~ \(N_{node}\) | - | |
Nabr1 | 三角形单元第1邻居序号\(i\) | 1 ~ \(N_{cell}\) | - | |
Nabr2 | 三角形单元第2邻居序号\(i\) | 1 ~ \(N_{cell}\) | - | |
Nabr3 | 三角形单元第3邻居序号\(i\) | 1 ~ \(N_{cell}\) | - | |
Zmax | 三角形单元z中心点地表高程 | -9999 ~ +inf | \(m\) |
Block 2 (三角形的三个角点的信息)
表头:
值1 | 值2 |
---|---|
行数( \(N_{node}\)) | 列数 (\(5\)) |
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
ID | 点序号 \(i\) | 1 ~ \(N_{cell}\) | - | |
X | x坐标 \(i\) | 1 ~ \(N_{node}\) | - | |
Y | y坐标 \(i\) | 1 ~ \(N_{node}\) | - | |
AqDepth | 含水层厚度(地表至不透水层距离)\(i\) | 0 ~ +inf | \(m\) | |
Elevation | 点的高程(z坐标) \(i\) | -9999 ~ +inf | \(m\) |
3.2.3.2 .sp.att文件
- 表头
值1 | 值2 |
---|---|
行数( \(N_{cell}\)) | 列数 (\(7\)) |
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
ID | 单元序号\(i\) | 1 ~ \(N_{cell}\) | - | |
SOIL | 土壤类型序号 | 1 ~ \(N_{soil}\) | - | |
GEOL | 类型序号 | 1 ~ \(N_{geol}\) | - | |
LC | 类型序号 | 1 ~ \(N_{lc}\) | - | \(N_{lc}\) = \(N_{lai}\) |
FORC | 气象站点序号 | 1 ~ \(N_{forc}\) | - | |
MF | 融雪指数序号 | 1 ~ \(N_{mf}\) | - | |
BC | 边界条件序号 | 1 ~ \(N_{bc}\) | - | |
SS | 源汇序号 | 1 ~ \(N_{bc}\) | - |
3.2.5 模型配置文件
3.2.5.1 .cfg.para文件
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 推荐值 |
---|---|---|---|---|
VERBOSE | 输出冗余信息 | - | - | 0 |
INIT_MODE | 初始条件模式 | 0~3 | - | 3 (0=Relief condition, 1=Dry condition, 2=Default guess, 3=Warm start) |
ASCII_OUTPUT | 是否输出文本格式结果 | 1/0 | - | 0 |
Binary_OUTPUT | 是否输出二进制格式结果 | 1/0 | - | 1 |
CRYOSPHERE | 冰冻圈模块是否开启 | 1/0 | - | 0 |
SPINUPDAY | 模型预热天数 | 0 ~ inf | \(day\) | 0 |
SCR_INTV | 屏幕输出间隔 | 0 ~ \(N_{threads}\) | \(min\) | 1440 |
ABSTOL | CVODE绝对容差 | 1e-6 ~ 0.1 | - | 0.0001 |
RELTOL | CVODE相对容差 | 1e-6 ~ 0.1 | - | 0.0001 |
INIT_SOLVER_STEP | 初始迭代步长 | - | \(min\) | 1 |
MAX_SOLVER_STEP | 最大迭代步长 | 1~60 | \(min\) | 10 |
ET_STEP | 正散发计算步长 | 1~360 | \(min\) | 60 |
START | 模型开始时间(天数) | 0 ~ inf | \(day\) | 0 |
END | 模型结束时间(天数) | - | \(day\) | - |
dt_ye_snow | 储量输出步长,积雪 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_ye_surf | 储量输出步长,地表水 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_ye_unsat | 储量输出步长,未饱和层 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_ye_gw | 储量输出步长,地下水层 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_Qe_surf | 单元流量输出步长,地表水 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_Qe_sub | 单元流量输出步长, 地下水 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_qe_et0 | 单元流量输出步长,截流蒸发 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_qe_et1 | 单元流量输出步长,蒸腾 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_qe_et2 | 单元流量输出步长,蒸发 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_qe_etp | 单元流量输出步长,潜在蒸散发 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_qe_prcp | 单元流量输出步长,降雨 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_qe_infil | 单元流量输出步长,下渗 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_qe_rech | 单元流量输出步长,地下水补给 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_yr_stage | 河段储量输出步长,河道 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_Qr_down | 河段流量输出步长,向下游 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_Qr_surf | 河段流量输出步长,向坡面 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_Qr_sub | 河段流量输出步长,向地下水 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_Qr_up | 河段流量输出步长,向上游 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
dt_Lake | 湖泊相关变量的输出步长 | 0 ~ inf | \(min\) | 1440 |
注:
- INIT_MODE:
- 0 = 含水层完全饱和作为初始条件,
- 1 = 含水层完全干涸,
- 2 = 未饱和层水量为含水层40%,饱和层水储量为含水层的40%,
- 3 = 读取.cfg.ic作为初始条件
3.2.5.2 .cfg.calib文件
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
GEOL_KSATH | 水平水力传导度,地下水层 | ? | - | |
GEOL_KSATV | 垂直水力传导度,地下水层 | ? | - | |
GEOL_KMACSATH | 大孔隙水平水力传导度,地下水层 | ? | - | |
GEOL_DMAC | 大孔隙深度,地下水层 | - | ||
GEOL_THETAS | 地下水层孔隙度,地下水层 | - | ||
GEOL_THETAR | 土壤残留含水量,地下水层 | - | ||
GEOL_MACVF | 大孔隙面积比,地下水层 | - | ||
SOIL_KINF | 饱和水力传导度,未饱和层 | ? | - | |
SOIL_KMACSATV | 大孔隙垂向水力传导度,未饱和层 | ? | - | |
SOIL_DINF | 下渗深度参数,未饱和层 | ? | - | |
SOIL_ALPHA | \(\alpha\)值,van Genuchten公式 | - | ||
SOIL_BETA | \(\beta\)值,van Genuchten公式 | - | ||
SOIL_MACHF | 大孔隙面积比,未饱和层 | - | ||
LC_VEGFRAC | 植被覆盖度 | - | ||
LC_ALBEDO | 反照率 | - | ||
LC_ROUGH | 地表曼宁粗糙度 | - | ||
LC_SOILDGD | 土壤劣化系数 | - | ||
LC_IMPAF | 不透水面积比 | - | ||
LC_ISMAX | 最大截流系数 | - | ||
AQ_DEPTH+ | 含水层深度 | \(m\) | ||
TS_PRCP | 降雨 | - | ||
TS_SFCTMP+ | 温度 | \(C\) | ||
ET_ETP | 潜在蒸散发 | - | ||
ET_IC | 冠层截流 | - | ||
ET_TR | 植被蒸腾 | - | ||
ET_SOIL | 直接蒸发 | - | ||
RIV_ROUGH | 河道曼宁粗糙度 | - | ||
RIV_KH | 河床水力传导度 | - | ||
RIV_DPTH+ | 河道深度 | \(m\) | ||
RIV_WDTH+ | 河道宽度 | \(m\) | ||
RIV_SINU | 河道绵延度 | - | ||
RIV_CWR | 谢才(Chezy)公式系数\(C_{wr}\) | - | ||
RIV_BSLOPE+ | 河床坡度 | \(m/m\) | ||
IC_GW+ | 地下水水位初始条件 | \(m\) | ||
IC_RIV+ | 河道水量初始条件 | \(m\) |
注:
- 表格中+代表该值的含义为该值与模型参数相加得到新参数。即\(\theta ^* = \theta + \zeta\), \(\theta\)为参数, \(\zeta\)为校准调节值。
- 除+以外的所有值,都是与参数相乘关系。即\(\theta ^* = \theta \times \zeta\)。
3.2.5.3 .cfg.ic文件
表1 (三角单元初始条件)
表头
值1 | 值2 |
---|---|
行数( \(N_{cell}\)) | 列数 (\(6\)) |
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
ID | 单元序号\(i\) | 1 ~ \(N_{cell}\) | - | |
Canopy | 冠层截流 \(i\) | 0 ~ inf | \(m\) | |
Snow | 积雪 \(i\) | 0 ~ inf | \(m\) | |
Surface | 地表水 \(i\) | 0 ~ inf | \(m\) | |
Unsat | 未饱和层水 \(i\) | 0 ~ inf | \(m\) | |
GW | 地下水 \(i\) | 0 ~ inf | \(m\) |
表2 (河段初始条件)
表头:
值1 | 值2 |
---|---|
行数( \(N_{riv}\)) | 列数 (\(2\)) |
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
ID | 河段序号 \(i\) | 1 ~ \(N_{riv}\) | - | |
Stage | 河段水位 \(i\) | 0 ~ inf | \(m\) |
表3 (湖泊初始条件)
表头:
值1 | 值2 |
---|---|
行数( \(N_{lake}\)) | 列数 (\(2\)) |
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
ID | 湖泊序号 \(i\) | 1 ~ \(N_{lake}\) | - | |
Stage | 湖泊水位 \(i\) | 0 ~ inf | \(m\) |
3.2.6 时间序列数据
3.2.6.1 .tsd.forc文件
- Line 1:
气象站点数量 | 开始日期 (YYYYMMDD)
- Line 2: 驱动数据文件所在文件夹
- Line 3~N: 时间序列数据文件名
- 表头:
值1 | 值2 |
---|---|
( \(0\)) | 列数 (\(6\)) |
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
Day | 日数 | 0 ~ \(N_{day}\) | \(day\) | |
PRCP | 降雨 | 0 ~ 500 | \(mm/day\) | 降雨强度超过阈值模型会警告,但不妨碍运行 |
TEMP | 气温 | -100 ~ 70 | \(C\) | |
RH | 相对湿度 | 0 ~ 1 | \(-\) | |
wind | 风速 | 0 ~ inf | \(m/s\) | 非负 |
Rn | 太阳净辐射 | ? | \(W/m^2\) | 最大值为太阳常数 |
Press | 气压 | ? | \(Pa\) | 可缺省 |
3.2.6.2 .tsd.lai文件
- 表头:
值1 | 值2 | 值3 |
---|---|---|
天数 ( \(N_{time}\)) | 列数 (\(N_{lc}\)) | 开始日期 (YYYYMMDD) |
- Table
列 | 含义 | 取值范围 | 单位 | 备注 |
---|---|---|---|---|
第一列 | 时间 | 0 ~ \(N_{time}\) | \(day\) | |
第2列 | 叶面积指数1 | 0 ~ inf | \(m^2/m^2\) | |
第i列 | 叶面积指数\(i-1\) | 0 ~ inf | \(m^2/m^2\) | |
… | … | … | … |
3.3 结果输出文件
3.3.1 文件名格式
为了方便结果的分类和用户理解,作者规则化定义了输出文件的文件名;用户通过文件名即可读懂文件所包含的变量类型、所属单元和读写格式。输出文件的文件名格式:
[项目名].[识别码].[格式]
或者:
[Project Name].[Identifier].[format]
[项目名]([Project Name]) 是用户给模拟定的名称,通常为流域的名字简写。例如:黄河流域,可以写成hh或者huanghe.
[格式] ([format])可以使用csv或者dat. csv为规则文本格式,可使用任意文本编辑器或者WPS表格打开。dat二进制格式,文件占用硬盘空间较小
[识别码] ([Identifier]) 定义了输出结果内涵。识别码基本结构为 [模型单元][变量类型][变量名]([Model cell][Variable Type][Variable Name])。 [Model cell] 是ele (element,模型三角单元), riv (river,河段) or lak (lake,湖泊). 变量类型包括 y, v and q,分别代表状态变量 (单位\(L\)), 单位流量或速度(单位\(L^3 L^{-2} T^{-1}\))和体积流量(in \(L^3 T^{-1}\))——\(L\)为长度单位,\(T\)为时间单位。
下表为SHUD输出文件列表:
识别码 | 单元 | 类型 | 变量名 | 含义 | 单位 | |
---|---|---|---|---|---|---|
.eleyic. | ele | y | ic | 储量,冠层截流 | \(m\) | |
.eleysnow. | ele | y | snow | 储量,雪水当量 | \(m\) | |
.eleysurf. | ele | y | surf | 储量,地表水 | \(m\) | |
.eleyunsat. | ele | y | unsat | 储量,未饱和层 | \(m\) | |
.eleygw. | ele | y | gw | 储量,地下水水位 | \(m\) | .GW |
.elevetp. | ele | v | etp | 通量,潜在蒸散发 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.eleveta. | ele | v | eta | 通量,实际蒸散发 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.elevetic. | ele | v | etic | 通量,冠层截流蒸发 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.elevettr. | ele | v | ettr | 通量,植被蒸腾 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.elevetev. | ele | v | etev | 通量,直接蒸发 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.elevprcp. | ele | v | prcp | 通量,降雨 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.elevnetprcp. | ele | v | netprcp | 通量,净降雨量 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.elevinfil. | ele | v | infil | 通量,下渗 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.elevexfil. | ele | v | infil | 通量,出渗(反下渗) | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.elevrech. | ele | v | rech | 通量,地下水补给 | \(\frac{m^3}{m^2 d}\) | |
.eleqsurf. | ele | q | surf | 流量,地表径流(坡面流) | \(m^3/d\) | |
.eleqsub. | ele | q | sub | 流量, 地下水水平流动 | \(m^3/d\) | |
.rivystage. | riv | y | stage | 储量,河段水位 | \(m\) | |
.rivqup. | riv | q | up | 流量,向上游 | \(m^3/d\) | |
.rivqdown. | riv | q | down | 流量,向下游 | \(m^3/d\) | |
.rivqsurf. | riv | q | surf | 流量,向坡面 | \(m^3/d\) | |
.rivqsub. | riv | q | sub | 流量,向地下水 | \(m^3/d\) |
3.3.2 文本格式输出文件(.csv)
N - 输出文件列数(不含时间列) m - 步长总数 StartTime - 开始时间 (YYYYMMDD or YYYYMMDD.hhmmss)
N | StartTime | ||||
---|---|---|---|---|---|
\(T_1\) | \(v_{1 \cdot 1}\) | \(v_{1 \cdot 2}\) | … | \(v_{1 \cdot N}\) | |
\(T_2\) | \(v_{2 \cdot 1}\) | \(v_{2 \cdot 2}\) | … | \(v_{2 \cdot N}\) | |
\(T_3\) | \(v_{3 \cdot 1}\) | \(v_{3 \cdot 2}\) | … | \(v_{3 \cdot N}\) | |
… | … | … | … | … | |
\(T_{m}\) | \(v_{m \cdot 1}\) | \(v_{m \cdot 2}\) | … | \(v_{m \cdot N}\) |
3.3.3 二进制输出文件(.dat)
二进制文件输出的结果核心矩阵与文本格式一致,但是使用了不同的存储结构。二进制文件格式紧凑,读写效率高,占用较小磁盘空间,因此作为SHUD模型的默认输出方式。 二进制文件格式不仅可被各类计算机语言(C/C++, Basic, Fortran,……)快速读取,并且也能在R、python、 Matlab、 Mathmetica等交互式语言中高效读取,如果读取有障碍,请联系模型作者获取帮助。
表格中,重要的变量是数据列数\(N_x\)。 \(N_x\)代表输出变量的列数,即该变量的输出计算单元数。
\(0 < N_x \le N_{max}\), 例如模型有\(N_{cell}\)个三角形单元,则.eleygw
的地下水输出文件中\(N_{max} = N_{cell}\);模型的河流径流结果中\(N_{max} = N_{riv}\)。
二进制输出文件现有v1.0, v2.0和v2.1三种格式,三种输出结果的格式见下表:
v 1.0 (\(N_x = N_{max}\))
内容 | 字节数 | 类型 | 示例 |
---|---|---|---|
数据列数 | 8 | double | 100 |
起始时间 | 8 | double | 20220101.120000 |
数据矩阵 | 8 | double | 1440, 1,2,…; 2880,2,4,… |
v 2.0(\(N_x = N_{max}\))
内容 | 字节数 | 类型 | 示例 |
---|---|---|---|
文件描述 | 1024 | char | groundwater export, bla bla bla |
起始时间 | 8 | double | 20220101.120000 |
数据列数 | 8 | double | 100 |
数据矩阵 | 8 | double | 1440, 1,2,…; 2880,2,4,… |
v 2.1 以上版本(\(0 < N_x \le N_{max}\))
内容 | 字节数 | 类型 | 示例 |
---|---|---|---|
版本号 | 8 | double | 2.0 |
文件描述 | 2048 | char | groundwater export, bla bla bla |
起始时间 | 8 | double | 20220101.120000 |
数据列数 | 8 | double | 100 |
索引ID | 8 | double | 1,3,5,…; |
数据矩阵 | 8 | double | 1440, 1,2,…; 2880,2,4,… |
注:double为计算机的双精度数据格式,默认长度为8个比特位
数据为\(m \times N_x\)的二维矩阵。
- 矩阵中的值全部为8字节double型。
- \(m\)为结果输出的最终时间长度,\(m=100\)表明模型共输出100个时间步长的数据,则数据矩阵的行数为100。
- \(N_x\)为输出结果的数量。 在v2.1之后的版本中,模型可灵活输出指定序号的结果,因此在v2.1结果中,结果矩阵的列数并不一定等于模拟单元的数量;例如模拟三角形单元数为1000(\(N_{max} = 1000\)),模型配置中指定值输出偶数序号的结果,则\(N_x = 500\),索引ID则为\(i_{o} = 2,4,6,...,998,1000\)。
- \(i\)为矩阵列序号,取值范围:\(0 \le i \le N_{x}\),第一列(\(i=0\))为时间,\(i=1~N_x\)则为输出结果值。
- \(j\)为时间序号,取值范围:$0 j m $。
- \(N_{h}\)为文件头的长度,换算为8字节double型的数量。
数据矩阵的存储方式见下表:
文件存储位置 | 矩阵行号(\(j=\)) | 数据列序号(\(i=\)) | 值 | 值含义 |
---|---|---|---|---|
\(N_{h} + 1\) | 1 | 0 | \(T_1\) | |
\(N_{h} + 2\) | 1 | 1 | \(v_{1 \cdot 1}\) | |
\(N_{h} + 3\) | 1 | 2 | \(v_{1 \cdot 2}\) | |
… | 1 | … | … | |
\(N_{h} +N_x\) | 1 | \(N_x\) | \(v_{1 \cdot N_x}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (2-1) + i\) | 2 | 0 | \(T_2\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (2-1) + i\) | 2 | 1 | \(v_{2 \cdot 1}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (2-1) + i\) | 2 | 2 | \(v_{2 \cdot 2}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (2-1) + i\) | 2 | … | … | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (2-1) + i\) | 2 | \(N_x\) | \(v_{2 \cdot N_x}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (3-1) + i\) | 3 | 0 | \(T_3\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (3-1) + i\) | 3 | 1 | \(v_{3 \cdot 1}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (3-1) + i\) | 3 | 2 | \(v_{3 \cdot 2}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (3-1) + i\) | 3 | … | … | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (3-1) + i\) | 3 | \(N_x\) | \(v_{3 \cdot N_x}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (j-1) + i\) | \(j\) | … | … | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (j-1) + i\) | \(j\) | … | … | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (j-1) + i\) | \(j\) | … | … | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (j-1) + i\) | \(j\) | … | … | |
… | … | … | … | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (m-1) + i\) | m | 0 | \(T_{m}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (m-1) + i\) | m | 1 | \(v_{m \cdot 1}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (m-1) + i\) | m | 2 | \(v_{m \cdot 2}\) | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (m-1) + i\) | m | … | … | |
\(N_{h} +(N_x+1) * (m-1) + i\) | m | \(N_x\) | \(v_{m \cdot N_x}\) |